MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4719

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014133	AATT	2	8	24	31	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014133	CACT	2	8	89	96	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014133	ATA	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014133	T	7	7	195	201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014133	ATA	2	6	212	217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014133	AAG	2	6	226	231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014133	TCA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014133	ATAA	2	8	257	264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014133	TAAT	3	12	271	282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014133	TATT	2	8	283	290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014133	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014133	TA	3	6	313	318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014133	A	6	6	921	926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014133	T	7	7	996	1002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014133	TTG	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014133	TCT	2	6	1420	1425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014133	TCT	2	6	1441	1446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014133	AGC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014133	ATT	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014133	CTT	2	6	1504	1509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014133	TAA	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014133	GTGA	2	8	2470	2477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014133	TGC	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014133	G	9	9	2487	2495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014133	T	6	6	2498	2503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014133	CGA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014133	CA	4	8	2622	2629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014133	CTTA	2	8	2648	2655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014133	TACAAC	2	12	2724	2735	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014133	GAT	2	6	2809	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014133	AT	3	6	2826	2831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014133	GATA	2	8	2852	2859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014133	ATTT	2	8	2874	2881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014133	T	7	7	2879	2885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014133	CAG	2	6	2899	2904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014133	CCG	2	6	2990	2995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014133	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014133	GAG	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014133	GAAA	2	8	3203	3210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014133	A	6	6	3684	3689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014133	A	6	6	4257	4262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014133	ATC	2	6	4417	4422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014133	A	6	6	4446	4451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014133	GT	3	6	4473	4478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014133	TAA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014133	TATT	2	8	4561	4568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014133	TGA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014133	A	6	6	4635	4640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014133	TGG	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014133	GAA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014133	AAT	2	6	4802	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014133	AAT	2	6	4871	4876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014133	CAG	2	6	4890	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014133	GTT	2	6	4911	4916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014133	ATT	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014133	T	7	7	4933	4939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014133	GAT	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014133	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014133	T	7	7	5166	5172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014133	GGA	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014133	TAA	2	6	7367	7372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014133	TGTA	2	8	7377	7384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014133	AATT	2	8	7393	7400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014133	CTT	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014133	T	7	7	7469	7475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014133	GTT	2	6	7484	7489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014133	TAA	2	6	7500	7505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014133	AATAA	2	10	7553	7562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014133	TGAGA	2	10	7580	7589	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014133	AAT	2	6	7622	7627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014133	TAT	2	6	7649	7654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014133	AT	3	6	7686	7691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014133	T	8	8	7691	7698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014133	TAA	2	6	9441	9446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014133	T	6	6	9456	9461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014133	TCG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014133	AT	3	6	9537	9542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014133	AG	3	6	9612	9617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014133	AAT	2	6	9670	9675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014133	AAG	2	6	9703	9708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014133	TTC	2	6	9750	9755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014133	AAC	2	6	9833	9838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014133	CTT	2	6	9869	9874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014133	TAA	2	6	9890	9895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014133	A	6	6	9900	9905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014133	TAT	2	6	11838	11843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014133	CG	3	6	11870	11875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014133	CCG	2	6	11948	11953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014133	ATA	2	6	11971	11976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014133	CTCGC	2	10	12042	12051	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_014133	TAA	2	6	13476	13481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014133	ATTC	2	8	13521	13528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014133	A	6	6	13529	13534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014133	TGTTT	2	10	13574	13583	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014133	T	6	6	13581	13586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014133	TAT	2	6	13612	13617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014133	A	6	6	13705	13710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014133	A	6	6	13727	13732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014133	A	6	6	13749	13754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014133	T	7	7	13771	13777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014133	A	6	6	13780	13785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014133	ATA	2	6	13802	13807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014133	CAA	2	6	13855	13860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014133	A	6	6	15609	15614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014133	AGA	2	6	15619	15624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014133	TCA	2	6	18611	18616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014133	TAT	2	6	21392	21397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014133	AGA	2	6	21403	21408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014133	GCATT	2	10	21440	21449	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014133	AAATTA	2	12	21469	21480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014133	GGT	2	6	21483	21488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014133	A	7	7	21912	21918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.